माइक्रो-इंजेक्शन (Micro Injection) एक ऐसी तकनीक है जिसमें पुनः संयोजक डीएनए को सीधे एक जानवर के केंद्रक में अंतःक्षिप्त किया जाता है। इसमें, एक ग्लास माइक्रोपिपेट के माध्यम से, विदेशी डीएनए सीधे एक जीवित कोशिका, oocyte या जानवर के भ्रूण में पहुँचाया जाता है।