पुनर्योगज डी०एन०ए० तकनीक के प्रमुख उपयोग निम्नलिखित हैं-
(i)औषधि में उपयोग: इस तकनीक द्वारा नये तथा सुरक्षित औषधि का उत्पादन किया जाता है, जिसे पुनर्योग औषधि भी कहते हैं। ये ड्रग्स प्रतिरोधी प्रतिक्रिया को बढ़ावा नहीं देते हैं। ऐसे करीब 30 ड्रग्स को मानव में उपयोग के लिए स्वीकृति दी गई है। इसमें से भारत में 12 ड्रग्स का विपणन भी किया गया है। इस ड्रग्स का उपयोग टीका निर्माण में भी किया जाता है।
(ii)कृषि में उपयोग: इसमें बाहरी जीन को प्रवेश कराकर रोगरोधी उन्नत पादप तथा जन्तुओं की किस्में तैयार की जाती है।
(iii)उद्योग में उपयोग: विभिन्न खाद्य पदार्थ सहित, डायरी उत्पाद तथा अलकोहलीय पेय पदार्थ का उत्पादन किया जाता है।